{"id":5391,"date":"2020-12-02T07:17:00","date_gmt":"2020-12-02T05:17:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.grupotordesillas.net\/?p=5391"},"modified":"2020-12-02T12:44:32","modified_gmt":"2020-12-02T10:44:32","slug":"la-ub-participa-en-la-secuenciacion-del-genoma-de-todas-las-especies-de-aves-del-mundo","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.grupotordesillas.net\/pt\/blog\/la-ub-participa-en-la-secuenciacion-del-genoma-de-todas-las-especies-de-aves-del-mundo\/","title":{"rendered":"La UB participa en la secuenciaci\u00f3n del genoma de todas las especies de aves del mundo"},"content":{"rendered":"\n
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El Bird 10,000 Genome Project (B10K), un consorcio internacional para secuenciar el genoma de todas las especies de p\u00e1jaros del mundo, ya ha secuenciado el genoma de un total de 363 especies de p\u00e1jaros en la segunda fase de este macroproyecto iniciado en 2015. Este logro cient\u00edfico publicado en la revista\u00a0Nature<\/a>\u00a0<\/em>constituye el mayor conjunto de datos de genomas completos de eucariotas secuenciados en un grupo biol\u00f3gico hasta la actualidad.<\/p>\n\n\n\n

En este trabajo impulsado por el B10K participan m\u00e1s de 150 investigadores de 125 instituciones de 24 pa\u00edses de todo el mundo, entre los que destacan los investigadores Marta Riutort, Julio Rozas, Jacob Gonz\u00e1lez-Sol\u00eds y Joan Ferrer Obiol, de la Facultad de Biolog\u00eda y del Instituto de Investigaci\u00f3n de la Biodiversidad de la UB (IRBio).<\/p>\n\n\n\n

El estudio publicado ahora en la revista Nature<\/em> presenta 267 nuevos genomas de aves que ampl\u00edan el material gen\u00e9tico secuenciado durante la primera fase y abren nuevas perspectivas sobre la evoluci\u00f3n de la diversidad gen\u00f3mica entre los diferentes linajes de p\u00e1jaros. Est\u00e1 dirigido por la Universidad de Copenhague (Dinamarca), el China National Genebank BGI-Shenzhen (China), la Academia China de Ciencias (China), el Museo Nacional Smithsonian de Historia Natural y la Universidad Rockefeller (Estados Unidos). Como innovaci\u00f3n, el trabajo ha empleado un m\u00e9todo de alineamiento de genomas (Cactus) que no requieren un genoma de referencia y que ha permitido identificar m\u00e1s del doble de regiones gen\u00f3micas hom\u00f3logas (ort\u00f3logas, 149 % m\u00e1s) respecto a estudios anteriores.<\/p>\n\n\n\n

La historia evolutiva de las aves al descubierto <\/strong><\/p>\n\n\n\n

Seg\u00fan las conclusiones, las aves paseriformes \u2014el orden con mayor n\u00famero de especies de p\u00e1jaros\u2014 presentan caracter\u00edsticas gen\u00f3micas que difieren de las de otros grupos de aves (por ejemplo, una copia adicional del gen de la hormona del crecimiento). Los p\u00e1jaros cantores \u2014el grupo con m\u00e1s especies dentro de los paseriformes\u2014 tambi\u00e9n han perdido un gen denominado cornulina, hecho que podr\u00eda haber contribuido a la evoluci\u00f3n de su amplio repertorio vocal.<\/p>\n\n\n\n

\u00abEn comparaci\u00f3n con el resto de grupos de p\u00e1jaros, los paseriformes \u2014orden que incluye especies de p\u00e1jaros tan conocidos como los gorriones o los jilgueros\u2014 tienen un mayor contenido de nucle\u00f3tidos guanina-citosina (GC) en las regiones del genoma que codifican por prote\u00ednas y utilizan una menor proporci\u00f3n de codones sin\u00f3nimos\u00bb, detalla el investigador Joan Ferrer-Obiol, del Departamento de Gen\u00e9tica, Microbiolog\u00eda y Estad\u00edstica de la UB. \u00abPor otro lado \u2014contin\u00faa\u2014, los piciformes \u2014grupo que incluye a los p\u00e1jaros carpinteros\u2014 presentan un n\u00famero de transposones muy superior al resto de \u00f3rdenes de p\u00e1jaros. En posteriores estudios se podr\u00e1 determinar la importancia biol\u00f3gica y evolutiva de estos descubrimientos\u00bb.<\/p>\n\n\n\n

Gracias al elevado n\u00famero de genomas de p\u00e1jaros secuenciados, se ha identificado un 10 % m\u00e1s de nucle\u00f3tidos del ADN altamente conservados. \u00abEstos componentes gen\u00e9ticos, hasta ahora desconocidos, est\u00e1n localizados sobre todo en regiones del genoma no codificantes por prote\u00ednas, y podr\u00edan tener una gran importancia funcional, especialmente en la regulaci\u00f3n de los genes (como los lncRNA, exones no traducidos o regiones de uni\u00f3n de factores de transcripci\u00f3n)\u00bb, subraya el catedr\u00e1tico Julio Rozas, miembro del Departamento mencionado y de la plataforma Bioinformatics Barcelona (BIB).<\/p>\n\n\n\n

El estudio gen\u00e9tico tambi\u00e9n ha facilitado la detecci\u00f3n de cambios impulsados por la selecci\u00f3n natural hasta el nivel de tan solo un nucle\u00f3tido del ADN. \u00abEsta potencia de detecci\u00f3n solo es posible cuando las especies est\u00e1n fuertemente representadas en los an\u00e1lisis gen\u00f3micos comparativos\u00bb, comenta Guojie Zhang, investigador principal del B10K y jefe del Centro Villum para la Biodiversidad Gen\u00f3mica de la Universidad de Copenhague. \u00abEstos genomas nos permiten explorar las variaciones gen\u00f3micas entre distintos grupos de p\u00e1jaros y ayudan a comprender mejor sus procesos de diversificaci\u00f3n\u00bb.<\/p>\n\n\n\n

La base gen\u00e9tica del comportamiento migratorio de la pardela cenicienta\u00a0<\/h2>\n\n\n\n

El equipo investigador UB-IRBio se ha centrado en la secuenciaci\u00f3n del genoma de la pardela cenicienta atl\u00e1ntica (Calonectris boreali<\/em>s), una especie migratoria de larga distancia que tiene colonias de cr\u00eda en las islas Canarias y pasa el invierno en lugares como las costas de Sud\u00e1frica y Namibia. Desde hace m\u00e1s de quince a\u00f1os, el grupo dirigido por el catedr\u00e1tico Jacob Gonz\u00e1lez-Sol\u00eds estudia el comportamiento migratorio de la especie mediante el uso de dispositivos de seguimiento remoto del movimiento (geolocalizadores GPS, etc.).<\/p>\n\n\n\n

\u00abAdem\u00e1s, el equipo colabora activamente en otro de los proyectos de gen\u00f3mica comparada que se est\u00e1n realizando a partir de los nuevos genomas y que tiene como objetivo identificar las regiones espec\u00edficas del genoma asociadas al comportamiento migratorio de las aves. En particular, se buscar\u00e1 la huella molecular de la convergencia evolutiva comparando los genomas de diversos grupos de aves en los que ha aparecido este comportamiento de forma independiente\u00bb, explica el catedr\u00e1tico Jacob Gonz\u00e0lez-Sol\u00eds, del Departamento de Biolog\u00eda Evolutiva, Ecolog\u00eda y Ciencias Ambientales de la UB.<\/p>\n\n\n\n

\u00abEl proyecto B10K todav\u00eda no est\u00e1 finalizado\u00bb, subraya la catedr\u00e1tica Marta Riutort, miembro del Departamento de Gen\u00e9tica, Microbiolog\u00eda y Estad\u00edstica de la UB. \u00abTodav\u00eda se est\u00e1n haciendo muchos an\u00e1lisis filogen\u00f3micos y de gen\u00f3mica comparativa que aportar\u00e1n nueva informaci\u00f3n sobre la historia evolutiva de los p\u00e1jaros. Disponer de toda esta informaci\u00f3n gen\u00f3mica y de una filogenia bien resuelta permitir\u00e1 llevar a cabo un gran n\u00famero de estudios, como la b\u00fasqueda de la base gen\u00e9tica de la migraci\u00f3n. Este conocimiento permitir\u00e1 entender mejor c\u00f3mo han evolucionado no solo los caracteres morfol\u00f3gicos o los propios genomas de los p\u00e1jaros, sino tambi\u00e9n otros m\u00e1s complejos como la migraci\u00f3n o los comportamientos sociales\u00bb.<\/p>\n\n\n\n

Trabajo de campo y museos para preservar una biodiversidad en peligro\u00a0<\/h2>\n\n\n\n

Buena parte de la secuenciaci\u00f3n de los genomas se ha basado en el an\u00e1lisis de muestras de tejido conservadas en museos de todo el mundo, lo cual ha permitido secuenciar genomas de p\u00e1jaros raros y en peligro de extinci\u00f3n. As\u00ed, han colaborado en la iniciativa centros como el Museo Nacional Smithsonian de Historia Natural, el Museo de Historia Natural de Dinamarca, el Museo de Ciencias Naturales de la Universidad Estatal de Luisiana y el Museo Nacional de Ciencias Naturales (MNCN-CSIC).<\/p>\n\n\n\n

Para Carsten Rahbek, coorganizador del proyecto B10K y antiguo conservador de p\u00e1jaros en el Museo de Historia Natural de Dinamarca, \u00abeste documento tambi\u00e9n es testimonio de c\u00f3mo avanza la ciencia de modo imprevisible en el tiempo. En opini\u00f3n de Peter Hosner, actual conservador de p\u00e1jaros del Museo de Historia Natural de Dinamarca, \u00abel estudio demuestra c\u00f3mo las inversiones en trabajos b\u00e1sicos de campo proporcionan valor a la investigaci\u00f3n durante d\u00e9cadas, una lecci\u00f3n importante en una \u00e9poca en que la naturaleza est\u00e1 desapareciendo de forma acelerada\u00bb.<\/p>\n\n\n\n

Todav\u00eda hay grandes preguntas abiertas sobre las relaciones evolutivas de los p\u00e1jaros. \u00abLos nuevos genomas tienen un papel clave en la comprensi\u00f3n de la diversificaci\u00f3n de p\u00e1jaros\u00bb, comenta Josefin Stiller, experta de la Universidad de Copenhague, que lidera los esfuerzos para construir un nuevo \u00e1rbol evolutivo de todas las familias de p\u00e1jaros. Por eso, ya est\u00e1 en marcha la nueva fase del proyecto, otro reto cient\u00edfico para secuenciar genomas de especies que representen los 2.250 g\u00e9neros de aves. En palabras del experto Erich Jarvis, coinvestigador principal del proyecto B10K y profesor de la Universidad Rockefeller y del Instituto M\u00e9dico Howard Hughes, \u00abpoder acceder a toda la diversidad gen\u00e9tica de aves nos ayudar\u00e1 a descifrar la gen\u00e9tica de sus diversos rasgos complejos, como el vuelo, el aprendizaje vocal y las altas densidades de neuronas cerebrales\u00bb.<\/p>\n\n\n\n

Fuente: https:\/\/www.ub.edu<\/a><\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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